La tercera clausura de la Universidad y el restablecimiento del Instituto de Ciencias

Medidas urgentes y transitorias en materia de educación media y superior (1860)

Mientras se elaboraba una ley que contuviera el nuevo plan de estudios, se aplicaría provisionalmente el decreto número 66 del Congreso del Estado de Jalisco, que contenía el citado Plan General de Enseñanza Pública de 1847.

Los patrimonios de la Universidad y del Seminario Conciliar pasarían a ser propiedad del Instituto y del Liceo.

Finalmente se dispuso que el clero pudiera enseñar en el Colegio Clerical las ciencias eclesiásticas para recibir las órdenes sacerdotales.