Desarrollo histórico (1791-1821)
Primer acto mayor de Medicina
El 7 de julio de 1796, el bachiller José Mariano García Diego y Moreno –el primer médico que egresó de la Universidad– sustentó el primer acto mayor de Medicina, dedicado al Ayuntamiento de Guadalajara. Lo presidió el catedrático de Prima de Medicina doctor Mariano García de la Torre, y el sustentante defendió
todas las Instituciones médicas de Herman Boerhaave: del primer libro, y de cien parágrafos del segundo de Cirugía expurgada de Juan Gorter: de la explicación de la Florificación del sistema de Limneo por don Antonio Palau, expositor de Botánica de Tournefort: de Catorce questiones médico-legales de Paulo Zacchias: de la Chímica de mr. Macquer y de los ocho libros de Aforismos de Hipócrates.1
Fue tal la pericia de la que hizo gala el sustentante, que el Claustro Pleno decidió otorgarle el grado de bachiller en Medicina.
El 3 de diciembre de 1796 tomó posesión del Obispado de Guadalajara el doctor Juan Cruz Ruiz de Cabañas y Crespo, quien dotó al edificio universitario del aula mayor o general, para la celebración de los actos académicos solemnes.
De junio a octubre de 1798, el Ayuntamiento y la Universidad entablaron una discusión debido a que ésta había retirado un fondo de cien pesos anuales destinado al pago de un profesor de primeras letras.
El presidente de la Real Audiencia, Jacobo de Ugarte, envió un oficio a la Universidad ordenándole que continuara la dotación, ya que era producto de un legado piadoso, o bien que informara las causas de la suspensión. A lo cual respondió el Claustro Universitario que del citado fondo piadoso de acuerdo con la real orden del 23 de agosto de 1791 se aplican los sobrantes a gastos de cera de oblata y demás gastos de sacristía y, en consecuencia, no había un fondo de donde dotar la mencionada plaza.
El 19 de agosto falleció el presidente de la Real Audiencia y primer vicepatrono real de la Universidad Jacobo de Ugarte, quien fue sustituido provisionalmente por el oidor decano Francisco de Saavedra, quien dispuso que para determinar si la Universidad debería continuar dotando la plaza del maestro de primeras letras, habría que consultar los documentos que había citado el síndico del Ayuntamiento. Al no encontrarse dichos documentos en el archivo del Ayuntamiento se le enteró al presidente de la Audiencia interino para que en consecuencia resolviera.2
El doctor Manuel Esteban Gutiérrez de Hermosillo, al ascender a la dignidad de chantre del Cabildo Eclesiástico, dejó su oficio de cancelario de la Universidad el 26 de junio de 1799, siendo sucedido como tal por el doctor Juan José Moreno y Pizano.3