Desarrollo histórico (1791-1821)
Primer Claustro Mayor o de Doctores
Fue integrado por los doctores: Pedro Díaz Escandón, Manuel Esteban Gutiérrez de Hermosillo, José María Gómez y Villaseñor, Francisco Esteban Morales y Ruiz, José Apolinario Vizcarra, Juan María Velázquez y Delgado, Francisco Javier Figueroa, José Simeón de Uría y Berrueco, Juan José Sánchez Leñero y José Ángel de la Sierra; y los licenciados Juan José Moreno y Pizano y Salvador Antonio de Roca y Guzmán. Todos profesionistas graduados en otras universidades, residentes en el territorio de la Intendencia de Guadalajara, y que incorporaron sus grados a la novel institución.1
El 15 de diciembre de 1792 la universidad celebró por primera vez a su patrona principal, la Inmaculada Concepción de María, con una misa en el Templo de Santo Tomás que ofició el cancelario Manuel Esteban Gutiérrez de Hermosillo, y en la cual ocupó la cátedra el rector José María Gómez y Villaseñor.